本实验室地处风景秀丽的厦门海滨,依托单位是国家海洋局第三海洋研究所(海洋三所),具有从事海洋生物资源研究开发的天然优势,也是我国唯一的“中国大洋生物基因研究开发基地”。本实验室原为第三海洋研究所生物工程实验室,由徐洵研究员于1991组建成立,也是我国第一个从事海洋生物基因工程研究的实验室。因在海洋病原生物的分子生物学研究、海水鱼类生长激素基因工程研究,以及海洋环境污染的生物检测技术研究方面成绩突出, 1997年被评为国家海洋局重点实验室。2004年成为国家科技部、厦门市共建的国家重点实验室培育基地。
近年来,实验室在深海极端微生物资源以及对虾病毒与抗病机制研究方面做了大量创新性工作。